一个提供对蛋白质数据银行(PDB)访问的模型上下文协议(MCP)服务器,PDB是全球关于蛋白质、核酸和复杂组装体3D结构信息的存储库。
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一个提供对蛋白质数据银行(PDB)访问的模型上下文协议(MCP)服务器,PDB是全球关于蛋白质、核酸和复杂组装体3D结构信息的存储库。
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SCMCP是一个用于单细胞RNA测序分析的自然语言处理工具,提供数据读写、预处理、工具模块、绘图和细胞间通讯分析等功能,适用于AI客户端、插件和代理框架。
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pip install scmcp

encode-toolkit
ENCODE Toolkit是一个集成了14个基因组数据库访问、7个分析流程和47个工作流技能的Claude插件,用于基因组数据搜索、分析和出版物方法生成。
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npx encode-toolkit
非官方的Open Targets MCP服务器,用于访问基因-药物-疾病关联研究数据。
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一个全面的模型上下文协议服务器,用于访问基因本体数据,支持基于本体的分析、基因注释研究和功能富集研究。
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提供对KEGG数据库的访问与生物数据分析功能的MCP服务器,支持LangChain集成和本地LLM模型。
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pip install -r requirements.txt

@smithery/cli@latest
一个功能完整的Model Context Protocol (MCP)服务器,提供Ensembl REST API的访问,适用于基因信息查询、变异数据分析等生物信息学任务。
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npx -y @smithery/cli@latest install @effieklimi/ensembl-mcp-server --client claude --key you...
一个提供人类蛋白质图谱数据访问的MCP服务器,包括蛋白质表达、亚细胞定位、病理学等信息。
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WormBase MCP Server是一个用于查询秀丽隐杆线虫和线虫基因组学的数据库服务,提供基因、蛋白质、表型等多维度数据查询功能。
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为Claude Code提供生命科学研究工具的MCP服务器和技能插件市场。
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一个提供全面访问KEGG(京都基因与基因组百科全书)数据库的MCP服务器,支持通路分析、基因研究、化合物调查和跨数据库链接,适用于生物信息学、系统生物学和药物发现等领域的研究人员。
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BioNext-MCP是一款通过自然语言对话进行生物信息学分析的智能助手,无需编程即可完成复杂分析任务。
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python --version
BioNext-MCP是一款通过自然语言交互实现无代码生物信息学分析的工具,支持单细胞RNA测序、基因组学、转录组学等多种分析类型,自动生成Python脚本并输出可视化报告。
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python --version
BioThings.io MCP服务器提供对MyGene.info和MyVariant.info等生物数据API的访问,支持基因和变体注释数据的无缝集成。
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CELLxGENE Census MCP Server是一个提供单细胞RNA测序数据查询和分析的服务,支持多物种数据查询、灵活过滤和内存高效处理。
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pip install -r requirements.txt
NCBI Model Context Protocol (MCP) 是一个用于与NCBI数据库交互的Python实现,支持自然语言查询和生物信息检索。
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pip install -r requirements.txt
Heuris-BioMCP是一个为生命科学研究设计的生物信息学模型协议服务器,连接ChatGPT、Claude等MCP客户端与生物数据源,支持研究、转化工作流和生产审查。
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pip install -e .
无需安装MCP服务器即可与Galaxy生物信息学平台交互的Markdown技能文件。
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pip install bioblend
BioGRID MCP服务器是一个提供基因和物理交互数据的端点服务,支持通过JSON调用获取交互网络、TSV边列表和统计分析,适用于生物信息学和机器学习应用。
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一个专业的生物信息学质量控制分析服务器,提供自动化的QC流程执行、HTML报告分析和高级数据可视化功能。
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python3 -m venv venv