克劳德代码生命科学市场
该市场为生命科学工具提供MCP(模型上下文协议)服务器和技能。安装这些插件,直接在Claude Code中访问专门的研究和分析工具。
内容包括:
- MCP服务器:连接到PubMed、BioRender、Synapse等外部服务
- 技能:特定领域的工作流程和分析能力,扩展了Claude的专业知识
快速开始
# Add the marketplace
/plugin marketplace add anthropics/life-sciences
# Install MCP servers
/plugin install pubmed@life-sciences
/plugin install biorender@life-sciences
/plugin install synapse@life-sciences
/plugin install wiley-scholar-gateway@life-sciences
/plugin install 10x-genomics@life-sciences
# Install skills
/plugin install single-cell-rna-qc@life-sciences
/plugin install instrument-data-to-allotrope@life-sciences
/plugin install nextflow-development@life-sciences
/plugin install scvi-tools@life-sciences
/plugin install scientific-problem-selection@life-sciences对于需要身份验证的服务器(PubMed除外),请在安装后配置凭据:
- 类型
/plugin克劳德代码 - 选择“管理插件”
- 查找已安装的服务器
- 选择“配置”
- 输入所需的凭据
- 重新启动Claude代码
可用插件
远程MCP服务器
PubMed
插件ID: pubmed@life-sciences
从PubMed搜索和访问生物医学文献和研究文章。
需求:无-所有用户都可以访问
生物渲染
插件ID: biorender@life-sciences
创建和访问科学插图和图表。
需求:免费BioRender帐户(https://www.biorender.com)
Synapse.org
插件ID: synapse@life-sciences
Sage Bionetworks的协同研究数据管理平台。
需求:免费Synapse帐户(https://www.synapse.org)
学者门户(威利)
插件ID: wiley-scholar-gateway@life-sciences
访问威利学者门户网站的学术研究和出版物。
需求:免费学者门户帐户
共识
插件ID: consensus@life-sciences
基于人工智能的搜索,涵盖了2亿多篇经过同行评审的科学研究论文,并进行了证据综合。
需求:共识账户(https://consensus.app)
Cortellis监管情报(Clarivate)
插件ID: cortellis@life-sciences
全球药品监管情报,涵盖提交、批准和指导文件。
需求:Cortellis订阅(https://clarivate.com/cortellis)
AdisInsight(施普林格·自然)
插件ID: adisinsight@life-sciences
药物开发管道、临床试验、安全性和交易情报。
需求:AdisInsight订阅(https://adisinsight.springer.com)
本地MCP服务器(MCPB)
10x基因组学云
插件ID: 10x-genomics@life-sciences
访问10x Genomics Cloud分析数据和工作流程。
需求:
- 10x基因组学云账户(https://www.10xgenomics.com/products/cloud-analysis)
- 访问令牌(生成自:https://cloud.10xgenomics.com/account/security)
- 注意:只有当您的帐户中有分析数据时才有用
技能
单细胞RNA-seq质量控制
插件ID: single-cell-rna-qc@life-sciences
遵循横向最佳实践的单细胞RNA-seq数据的自动化质量控制工作流程。通过全面的可视化执行基于MAD的过滤。
同素异形体的仪器数据
插件ID: instrument-data-to-allotrope@life-sciences
将仪器数据转换为Allotrope Simple Model(ASM)格式,以进行标准化的数据交换和分析。
Nextflow开发
插件ID: nextflow-development@life-sciences
在本地或公共GEO/SRA测序数据上运行nf-core生物信息学管道(rnaseq、sarek、atacseq)。专为需要在没有专业生物信息学培训的情况下进行大规模组学分析的实验室科学家而设计。
支持的管道:
- Rnaseq:基因表达和差异表达分析
- 萨瑞克:种系和体细胞变体调用(WGS/WES)
- atacseq:染色质可及性分析
特征:
- 从GEO/SRA下载公共数据集
- 自动检测数据类型并建议适当的管道
- 生成与管道兼容的样本表
- 环境验证和故障排除指南
需求:本地安装Docker和Nextflow
scvi工具
插件ID: scvi-tools@life-sciences
使用scvi工具进行单细胞组学分析的深度学习工具包。包括scVI、scANVI、totalVI、PeakVI、MultiVI等的模型选择指导、培训工作流程和集成管道。
科学问题选择
插件ID: scientific-problem-selection@life-sciences
科学问题选择和战略研究决策的系统框架。基于Fischbach和Walsh在Cell(2024)的方法论,这项技能可以帮助研究人员进行项目构思、风险评估、解决卡住的项目和战略科学规划。
使用案例:
- 推销和完善新的研究思路
- 评估项目风险和可行性
- 在活动项目中导航决策树
- 战略研究规划与问题选择
详细安装
1.添加市场(一次)
/plugin marketplace add https://github.com/anthropics/life-sciences.git2.安装特定插件
# Remote MCP servers (no configuration needed for PubMed)
/plugin install pubmed@life-sciences
/plugin install biorender@life-sciences
/plugin install synapse@life-sciences
/plugin install wiley-scholar-gateway@life-sciences
# Local MCP servers (require configuration)
/plugin install 10x-genomics@life-sciences
# Skills (no configuration needed)
/plugin install single-cell-rna-qc@life-sciences
/plugin install instrument-data-to-allotrope@life-sciences
/plugin install nextflow-development@life-sciences
/plugin install scvi-tools@life-sciences
/plugin install scientific-problem-selection@life-sciences3.配置凭据(如果需要)
对于需要身份验证的服务器,请使用 /plugin 菜单:
- 类型
/plugin克劳德代码 - 选择“管理插件”
- 查找已安装的服务器
- 选择“配置”(如果可用)
- 输入您的API证书
或者在收到提示时通过服务器的web界面进行身份验证。
4.重新启动克劳德代码
重新启动以激活MCP服务器。
身份验证要求
- 无身份验证:PubMed
- 需要免费帐户:BioRender、Synapse、威利学者门户、共识
- 付费/机构账户:10x基因组学(需要账户中的数据才有用),Cortellis,AdisInsight
支持
对于以下问题:
- 克劳德代码插件系统:在#claude-cli上报告对Anthropic Slack的反馈
- 单个MCP服务器:联系相应提供商的支持
许可证
单个MCP服务器由其各自的提供商授权。有关详细信息,请参阅每个提供商的服务条款。
已删除插件
- 奔岭:已删除,因为Benchling使用插件系统不支持的租户特定URL。
