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Life Sciences

MCP Server

为Claude Code提供生命科学研究工具的MCP服务器和技能插件市场。

工具数

0

提示词数

0

GitHub Stars

375

资源数

0
PythonClaude生物信息学Claude

安装说明

本站只整理中文说明和来源信息,不托管安装包,也不代用户安装。

作者 / 组织

anthropics

提供方

anthropics

最后核验

2026/5/17 20:23

快速接入

先看主来源和安装命令,再打开仓库或文档;下面只保留这个条目的关键接入事实。

详细介绍

克劳德代码生命科学市场

该市场为生命科学工具提供MCP(模型上下文协议)服务器和技能。安装这些插件,直接在Claude Code中访问专门的研究和分析工具。

内容包括:

  • MCP服务器:连接到PubMed、BioRender、Synapse等外部服务
  • 技能:特定领域的工作流程和分析能力,扩展了Claude的专业知识

快速开始

# Add the marketplace
/plugin marketplace add anthropics/life-sciences

# Install MCP servers
/plugin install pubmed@life-sciences
/plugin install biorender@life-sciences
/plugin install synapse@life-sciences
/plugin install wiley-scholar-gateway@life-sciences
/plugin install 10x-genomics@life-sciences

# Install skills
/plugin install single-cell-rna-qc@life-sciences
/plugin install instrument-data-to-allotrope@life-sciences
/plugin install nextflow-development@life-sciences
/plugin install scvi-tools@life-sciences
/plugin install scientific-problem-selection@life-sciences

对于需要身份验证的服务器(PubMed除外),请在安装后配置凭据:

  1. 类型 /plugin 克劳德代码
  2. 选择“管理插件”
  3. 查找已安装的服务器
  4. 选择“配置”
  5. 输入所需的凭据
  6. 重新启动Claude代码

可用插件

远程MCP服务器

PubMed

插件ID: pubmed@life-sciences

从PubMed搜索和访问生物医学文献和研究文章。

需求:无-所有用户都可以访问

生物渲染

插件ID: biorender@life-sciences

创建和访问科学插图和图表。

需求:免费BioRender帐户(https://www.biorender.com)

Synapse.org

插件ID: synapse@life-sciences

Sage Bionetworks的协同研究数据管理平台。

需求:免费Synapse帐户(https://www.synapse.org)

学者门户(威利)

插件ID: wiley-scholar-gateway@life-sciences

访问威利学者门户网站的学术研究和出版物。

需求:免费学者门户帐户

共识

插件ID: consensus@life-sciences

基于人工智能的搜索,涵盖了2亿多篇经过同行评审的科学研究论文,并进行了证据综合。

需求:共识账户(https://consensus.app)

Cortellis监管情报(Clarivate)

插件ID: cortellis@life-sciences

全球药品监管情报,涵盖提交、批准和指导文件。

需求:Cortellis订阅(https://clarivate.com/cortellis)

AdisInsight(施普林格·自然)

插件ID: adisinsight@life-sciences

药物开发管道、临床试验、安全性和交易情报。

需求:AdisInsight订阅(https://adisinsight.springer.com)

本地MCP服务器(MCPB)

10x基因组学云

插件ID: 10x-genomics@life-sciences

访问10x Genomics Cloud分析数据和工作流程。

需求:

  • 10x基因组学云账户(https://www.10xgenomics.com/products/cloud-analysis)
  • 访问令牌(生成自:https://cloud.10xgenomics.com/account/security)
  • 注意:只有当您的帐户中有分析数据时才有用

技能

单细胞RNA-seq质量控制

插件ID: single-cell-rna-qc@life-sciences

遵循横向最佳实践的单细胞RNA-seq数据的自动化质量控制工作流程。通过全面的可视化执行基于MAD的过滤。

同素异形体的仪器数据

插件ID: instrument-data-to-allotrope@life-sciences

将仪器数据转换为Allotrope Simple Model(ASM)格式,以进行标准化的数据交换和分析。

Nextflow开发

插件ID: nextflow-development@life-sciences

在本地或公共GEO/SRA测序数据上运行nf-core生物信息学管道(rnaseq、sarek、atacseq)。专为需要在没有专业生物信息学培训的情况下进行大规模组学分析的实验室科学家而设计。

支持的管道:

  • Rnaseq:基因表达和差异表达分析
  • 萨瑞克:种系和体细胞变体调用(WGS/WES)
  • atacseq:染色质可及性分析

特征:

  • 从GEO/SRA下载公共数据集
  • 自动检测数据类型并建议适当的管道
  • 生成与管道兼容的样本表
  • 环境验证和故障排除指南

需求:本地安装Docker和Nextflow

scvi工具

插件ID: scvi-tools@life-sciences

使用scvi工具进行单细胞组学分析的深度学习工具包。包括scVI、scANVI、totalVI、PeakVI、MultiVI等的模型选择指导、培训工作流程和集成管道。

科学问题选择

插件ID: scientific-problem-selection@life-sciences

科学问题选择和战略研究决策的系统框架。基于Fischbach和Walsh在Cell(2024)的方法论,这项技能可以帮助研究人员进行项目构思、风险评估、解决卡住的项目和战略科学规划。

使用案例:

  • 推销和完善新的研究思路
  • 评估项目风险和可行性
  • 在活动项目中导航决策树
  • 战略研究规划与问题选择

详细安装

1.添加市场(一次)

/plugin marketplace add https://github.com/anthropics/life-sciences.git

2.安装特定插件

# Remote MCP servers (no configuration needed for PubMed)
/plugin install pubmed@life-sciences
/plugin install biorender@life-sciences
/plugin install synapse@life-sciences
/plugin install wiley-scholar-gateway@life-sciences

# Local MCP servers (require configuration)
/plugin install 10x-genomics@life-sciences

# Skills (no configuration needed)
/plugin install single-cell-rna-qc@life-sciences
/plugin install instrument-data-to-allotrope@life-sciences
/plugin install nextflow-development@life-sciences
/plugin install scvi-tools@life-sciences
/plugin install scientific-problem-selection@life-sciences

3.配置凭据(如果需要)

对于需要身份验证的服务器,请使用 /plugin 菜单:

  1. 类型 /plugin 克劳德代码
  2. 选择“管理插件”
  3. 查找已安装的服务器
  4. 选择“配置”(如果可用)
  5. 输入您的API证书

或者在收到提示时通过服务器的web界面进行身份验证。

4.重新启动克劳德代码

重新启动以激活MCP服务器。

身份验证要求

  • 无身份验证:PubMed
  • 需要免费帐户:BioRender、Synapse、威利学者门户、共识
  • 付费/机构账户:10x基因组学(需要账户中的数据才有用),Cortellis,AdisInsight

支持

对于以下问题:

  • 克劳德代码插件系统:在#claude-cli上报告对Anthropic Slack的反馈
  • 单个MCP服务器:联系相应提供商的支持

许可证

单个MCP服务器由其各自的提供商授权。有关详细信息,请参阅每个提供商的服务条款。

已删除插件

  • 奔岭:已删除,因为Benchling使用插件系统不支持的租户特定URL。

目录标签

目录标签

PythonClaude生物信息学生命科学本地部署研究工具数据分析科研协作

支持客户端

Claude

接入字段

传输方式(transport,传输协议)

未说明

鉴权方式(authType,认证方式)

none

工具数量(toolCount,工具数)

0

资源数量(resourceCount,资源数)

0

提示词数量(promptCount,提示词数)

0

权限和风险

未说明none部署方式未说明

接入前请确认传输方式、认证方式和部署位置,并根据实际工具能力限制访问范围。

安装前确认

不要直接授予不必要的文件、网络或账号权限;先核对安装命令和配置内容。

仍需确认:installCommand

来源信息

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