一个提供全面访问NCBI数据集API的模型上下文协议(MCP)服务器,支持通过31种专业工具无缝集成NCBI的基因组、分类学和生物学数据。
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一个提供全面访问NCBI数据集API的模型上下文协议(MCP)服务器,支持通过31种专业工具无缝集成NCBI的基因组、分类学和生物学数据。
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MCPymol是一个通过自然语言指令操作PyMOL进行蛋白质结构分析和可视化的工具,支持高级视图设置和结构探索。
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python3 -m venv .venv
一个非官方的模型上下文协议服务器,用于访问Open Targets平台数据,支持基因-药物-疾病关联研究。
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一个提供全面访问KEGG(京都基因与基因组百科全书)数据库的MCP服务器,支持通路分析、基因研究、化合物调查和跨数据库链接,适用于生物信息学、系统生物学和药物发现等领域的研究人员。
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9
BioNext-MCP是一款通过自然语言对话进行生物信息学分析的智能助手,无需编程即可完成复杂分析任务。
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python --version
BioNext-MCP是一款通过自然语言交互实现无代码生物信息学分析的工具,支持单细胞RNA测序、基因组学、转录组学等多种分析类型,自动生成Python脚本并输出可视化报告。
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python --version
TogoMCP是一个为AI助手提供生物和生物医学RDF数据库访问的MCP服务器,支持SPARQL查询和REST API集成。
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docker run -e NCBI_API_KEY="your-key-here" -p 8000:8000 togo-mcp
BioThings.io MCP服务器提供对MyGene.info和MyVariant.info等生物数据API的访问,支持基因和变体注释数据的无缝集成。
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一个精选的医疗、医学和生命科学领域的MCP(Model Context Protocol)服务器列表。
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为Benchling平台提供模型上下文协议(MCP)服务器,实现实验室数据管理和研究流程的标准化接口,支持AI助手与生物数据平台的交互。
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uvx --version
Cytoscape MCP Server是一个嵌入在Cytoscape桌面应用中的Model Context Protocol (MCP)服务器,允许AI客户端通过HTTP连接并调用工具直接控制桌面应用,如加载网络、设置活动视图等。
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GenomeMCP是一个基于AI的基因组智能分析工具,通过Model Context Protocol(MCP)服务器提供实时临床基因组数据库查询、科学文献检索、群体遗传学分析和生物通路可视化功能。
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uv run python src/main.py
Posebusters MCP Server是一个基于PoseBusters的MCP兼容API,用于验证分子对接姿势的物理和化学合理性。
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docker run -p 7860:7860 posebusters-mcp-server
一个用于访问STRING蛋白质交互数据库的模型上下文协议(MCP)服务器,提供蛋白质网络分析、功能富集和比较基因组学工具。
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提供蛋白质结构和序列分析的核心功能,包括结构加载、距离计算、序列比对和数据库集成,适用于生物信息学研究和开发。
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uv run stdio
CELLxGENE Census MCP Server是一个提供单细胞RNA测序数据查询和分析的服务,支持多物种数据查询、灵活过滤和内存高效处理。
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pip install -r requirements.txt
NCBI Model Context Protocol (MCP) 是一个用于与NCBI数据库交互的Python实现,支持自然语言查询和生物信息检索。
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pip install -r requirements.txt
一个用于TCGA癌症类型分析的R包工具,提供MCP服务器配置和肿瘤类型查询功能。
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2
一个提供对EBI BioStudies数据库可靠访问的简化MCP服务器,专注于生物研究元数据的提取和验证。
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BoltzGen MCP是一款基于Docker和模型上下文协议的AI蛋白质设计工具,可设计蛋白质结合物、肽结合物和定制蛋白质,支持多种协议和异步作业队列。
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