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MCP 工具与服务目录

找到适合你的 MCP Server,快速完成接入

按功能、传输方式和来源整理 MCP Server,提供安装命令、配置方式、仓库与文档入口,方便你快速比较并接入合适的服务。

正式条目

87,640

可复制安装

36,828

最近生成

2026-05-22

运维云端stdio

evo2 DNA语言模型的MCP服务器,支持生成和分析DNA序列,适用于基因组研究和生物信息学应用。

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4

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0

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pip install -e .[dev]

搜索检索stdio

一个高性能的统一模型上下文协议(MCP)服务器,使Claude Desktop能够根据基因突变在clinicaltrials.gov上搜索匹配的临床试验。

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uv run python -m unittest discover tests/

运维云端stdio

一个基于scvi-tools的MCP服务器,用于单细胞组学数据的深度概率分析,支持自然语言交互,提供SCVI、SCANVI、TOTALVI和PEAKVI等多种工具。

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20

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0

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python3 -m venv venv

AI代理stdio

全面解析Bioconda MCP ServerMCP Server的核心功能、安装配置和实用案例。作为顶级Model Context Protocol服务器,Bioconda MCP Server能让AI助手访问实时数据、执行操作,为您提供更智能的工作体验和自动化解决方案。

运维云端stdio

一个模型上下文协议(MCP)服务器,将Open Targets平台的GraphQL API作为一系列工具暴露出来,供Claude Desktop和其他兼容MCP的客户端使用。

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68

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17

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uvx --from git+https://github.com/nickzren/opentargets-mcp opentargets-mcp

运维云端stdio

MCPymol是一个通过自然语言指令操作PyMOL进行蛋白质结构分析和可视化的工具,支持高级视图设置和结构探索。

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13

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python3 -m venv .venv

数据服务stdio

BioNext-MCP是一款通过自然语言对话进行生物信息学分析的智能助手,无需编程即可完成复杂分析任务。

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8

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python --version

数据服务stdio

BioNext-MCP是一款通过自然语言交互实现无代码生物信息学分析的工具,支持单细胞RNA测序、基因组学、转录组学等多种分析类型,自动生成Python脚本并输出可视化报告。

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8

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python --version

AI代理stdio

TogoMCP是一个为AI助手提供生物和生物医学RDF数据库访问的MCP服务器,支持SPARQL查询和REST API集成。

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8

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docker run -e NCBI_API_KEY="your-key-here" -p 8000:8000 togo-mcp

运维云端stdio

为Benchling平台提供模型上下文协议(MCP)服务器,实现实验室数据管理和研究流程的标准化接口,支持AI助手与生物数据平台的交互。

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uvx --version

运维云端stdio

GenomeMCP是一个基于AI的基因组智能分析工具,通过Model Context Protocol(MCP)服务器提供实时临床基因组数据库查询、科学文献检索、群体遗传学分析和生物通路可视化功能。

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10

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uv run python src/main.py

运维云端stdio

Posebusters MCP Server是一个基于PoseBusters的MCP兼容API,用于验证分子对接姿势的物理和化学合理性。

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5

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docker run -p 7860:7860 posebusters-mcp-server

搜索检索stdio

提供蛋白质结构和序列分析的核心功能,包括结构加载、距离计算、序列比对和数据库集成,适用于生物信息学研究和开发。

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3

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uv run stdio

数据服务stdio

CELLxGENE Census MCP Server是一个提供单细胞RNA测序数据查询和分析的服务,支持多物种数据查询、灵活过滤和内存高效处理。

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4

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3

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pip install -r requirements.txt

数据服务stdio

NCBI Model Context Protocol (MCP) 是一个用于与NCBI数据库交互的Python实现,支持自然语言查询和生物信息检索。

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14

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3

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pip install -r requirements.txt

开发工具stdio

ChimeraX MCP服务器是一个连接AI编程工具与UCSF ChimeraX的桥梁,允许用户通过自然语言交互加载、编辑、可视化和分析蛋白质结构。

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39

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2

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pip install chimerax-mcp

运维云端stdio

该项目利用大型语言模型(LLMs)自动分析蛋白质结构,识别链类型并生成定量标记,适用于T细胞受体(TCR)和肽-MHC(pMHC)复合物相互作用研究。

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0

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1

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pip install "mcp[cli]" chatmol

搜索检索stdio

为AI代理提供基因搜索、蛋白质结构、临床变异、PubMed文献和DNA序列等生物信息学和生命科学数据处理服务。

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10

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1

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pip install bioinformatics-mcp-server

数据服务stdio

Heuris-BioMCP是一个为生命科学研究设计的生物信息学模型协议服务器,连接ChatGPT、Claude等MCP客户端与生物数据源,支持研究、转化工作流和生产审查。

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31

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1

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pip install -e .

AI代理stdio

通过模型上下文协议(MCP)公开欧洲核苷酸档案(ENA)的REST服务子集,使AI代理能够以安全、结构化和可复现的方式与ENA进行程序化交互。

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5

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1

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python -m venv venv