
Biomart MCP
@smithery/cli
一个基于Model Context Protocol (MCP)的服务器,用于与Biomart数据库交互,提供数据集发现、属性过滤、数据检索和ID转换等功能。
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npx -y @smithery/cli install @jzinno/biomart-mcp --client claude

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一个基于Model Context Protocol (MCP)的服务器,用于与Biomart数据库交互,提供数据集发现、属性过滤、数据检索和ID转换等功能。
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一个允许语言模型从UniProt数据库获取蛋白质信息的MCP服务器,可集成到Claude Desktop和其他MCP兼容的AI应用中。
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python -m venv venv
全面解析Bioconda MCP ServerMCP Server的核心功能、安装配置和实用案例。作为顶级Model Context Protocol服务器,Bioconda MCP Server能让AI助手访问实时数据、执行操作,为您提供更智能的工作体验和自动化解决方案。
全面解析Oh My Kegg MCPMCP Server的核心功能、安装配置和实用案例。作为顶级Model Context Protocol服务器,Oh My Kegg MCP能让AI助手访问实时数据、执行操作,为您提供更智能的工作体验和自动化解决方案。
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pip install -r requirements.txt
Kiro powers提供了一系列专为增强AI代理能力而设计的工具和流程,涵盖AWS基础设施构建、服务器应用开发、生物信息学工作流管理等多个技术领域。
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290
TogoMCP是一个为AI助手提供生物和生物医学RDF数据库访问的MCP服务器,支持SPARQL查询和REST API集成。
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docker run -e NCBI_API_KEY="your-key-here" -p 8000:8000 togo-mcp
本课程探讨模型上下文协议(MCP)在构建和集成生物信息学工作流AI代理中的实际应用,涵盖从基础概念到高级部署的多个实验。
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通过模型上下文协议(MCP)公开欧洲核苷酸档案(ENA)的REST服务子集,使AI代理能够以安全、结构化和可复现的方式与ENA进行程序化交互。
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python -m venv venv
提供用于访问nf-core管道和模块工具的工具套件,包括创建管道、列出模块、创建模块和安装现有模块等功能。
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一个提供基因和衰老相关数据查询的MCP服务器,支持基因搜索、分类学工具、蛋白质工具、疾病工具和研究工具等功能。
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一个MCP(模型上下文协议)服务器,允许AI代理通过自然语言驱动RELION 5.x进行冷冻电镜结构解析。
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pip install mcp pydantic
SmartAPI MCP Server 是一个为SmartAPI注册表中的API创建MCP(模型上下文协议)服务器的工具,专注于生物信息学和生命科学API的集成与交互。
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pip install smartapi-mcp
BV-BRC数据MCP服务器是一个基于Flask的模型上下文协议服务器,通过bvbrc-solr-python-api模块提供对BV-BRC(细菌和病毒生物信息学资源中心)数据的访问,包括基因组和基因组特征数据的查询功能。
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python3 -m venv .venv
一个提供程序化访问SNP数据的MCP服务器,支持通过标准化接口查询经过整理的基因组学信息。
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bio-mcp-interpro MCP服务器通过Model Context Protocol提供InterProScan蛋白质域和功能分析能力,支持同步和异步蛋白质序列分析,适用于大规模生物信息学工作流。
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pip install loguru click pandas numpy tqdm
InterPro MCP Server通过Model Context Protocol (MCP)与Claude AI集成,提供蛋白质域、结构和分类数据的API访问。
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python test_interpro_api.py
MCP-Frogs是一个基于Model Context Protocol (MCP)的服务,用于协调和异步管理FROGS元基因组分析管道,通过LLM(如Claude)进行对话式交互。
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pip install -r mcp_server/requirements.txt
一个基于NCBI BLAST服务的DNA序列相似性搜索工具,提供Web界面和API访问,用于识别DNA序列的匹配生物体和基因。
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pip install -r requirements.txt

esbuild
miEAA3_MCP是一个集成miEAA 3.x REST API与Claude Desktop的模型上下文协议服务器,提供微RNA和前体富集分析功能。
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npx esbuild src/server.ts --bundle --platform=node --format=esm --target=node18 --outfile=di...
OakVar MCP Server是一个通过Model Context Protocol (MCP)将OakVar的基因组变异分析功能暴露给AI助手的服务。
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pip install oakvar oakvar-mcp