SNOMED CT MCP服务器
A. 模型上下文协议 查询服务器 SNOMED CT 通过临床术语 NCBO生物门户 REST API。
可用工具
| 工具 | 参数 | 描述 |
|---|---|---|
search | query limit domain | 通过文本查询搜索SNOMED CT概念。可选的 domain 滤波器将结果限制到SNOMED分支（例如。， procedure). |
get_concept | concept_id include_detail | 获取完整的概念细节：标签、定义、同义词、父母和临床关系。 |
get_hierarchy | concept_id relation limit | 浏览SNOMED CT层次结构（父母、子女、祖先、后代）。 |
快速开始
先决条件
- Python 3.12+
- 紫外线
- BioPortal API密钥（免费 Bioportl.bioontology.org/account)
作为工具安装
git clone https://github.com/robsyc/snomed-mcp && cd snomed-mcp
uv tool install .然后添加到您的 .cursor/mcp.json 或Claude桌面配置：
{
"mcpServers": {
"snomed-mcp": {
"command": "snomed-mcp",
"env": {
"BIOPORTAL_API_KEY": "your-api-key"
}
}
}
}用紫外线跑步
git clone https://github.com/robsyc/snomed-mcp && cd snomed-mcp
uv sync添加到您的 .cursor/mcp.json 或Claude桌面配置：
{
"mcpServers": {
"SNOMED CT": {
"command": "uv",
"args": ["tool", "run", "snomed-mcp"],
"env": {
"BIOPORTAL_API_KEY": "your-api-key"
}
}
}
}使用示例
“搜索与心力衰竭相关的SNOMED CT概念”
“搜索阑尾切除术 procedure 仅域”“获取SNOMED概念195967001的完整细节”
“让我看看73211009（糖尿病）概念的孩子”
生物门户API
此服务器包装 BioPortal REST API.关键细节：
- 认证：API密钥通过
Authorization: apikey token=...头球 - SNOMED CT本体：访问方式为
SNOMEDCT在BioPortal - 概念URI:
http://purl.bioontology.org/ontology/SNOMEDCT/{concept_id} - 速率限制：15个请求/秒（客户端强制）
发展
uv sync --group dev
# Lint
uv run ruff check src/ tests/
# Tests
uv run pytest tests/ -v
# MCP Inspector (web UI for testing tools)
BIOPORTAL_API_KEY=your-key uv run fastmcp dev inspector src/snomed_mcp/server.py:mcp