PubMed+CiNii MCP服务器
一种模型上下文协议（MCP）服务器，提供对PubMed（英文文献）和CiNii Research（日本文献）数据的访问。
PubMed（英语文献）和CiNii Research（日语文献）两者都能检索的合并MCP (Model Context Protocol) 服务器。
Features / 机能一覧
PubMed Tools (English Literature / 英語文献)
| Tool / 工具Description / 说明 | |
|---|---|
search | PubMed search with MeSH support (1-200 results) / PubMed搜索（MeSH支持，1-200件） |
fetch | Retrieve abstract for a single PMID / 单一PMID的抽象检索 |
fetch_batch | Retrieve abstracts for multiple PMIDs / 复数PMID的抽象批量获取 |
get_full_text | Retrieve full text for PMCID / PMCIDの全文取得 |
count | Get result count for a query / 検索结果件数の取得 |
find_similar_articles | Find similar articles / 类似论文の検索 |
export_to_ris | Export to RIS format / RIS格式导出 |
get_citation_counts | Get citation counts via iCite API / iCite APIで被引用数取得 |
download_pdfs | Download PDFs / PDF下载 |
CiNii Tools (Japanese Literature / 日本語文献)
| Tool / 工具Description / 说明 | |
|---|---|
search_japanese | CiNii Research search (includes abstracts) / CiNii Research検索（抄録含む） |
export_to_ris_japanese | Export Japanese articles to RIS format / 日语论文RIS格式导出 |
Setup / 安装，安装
1. Install Dependencies / 安装相关性
pip install -r requirements.txt2. Environment Configuration / 环境设定
复制 .env.example 到 .env 并配置您的API密钥。 .env.example 的 .env 复制到API请设置键。
cp .env.example .env3. Start the Server / 启动服务器
python pubmed_mcp_server.py服务器将在以下位置可用： http://localhost:8000/mcp （流式HTTP） 服务器是 http://localhost:8000/mcp 中所述修改相应参数的值。
API Key Registration / API 获取密钥的方法
NCBI API密钥（用于PubMed/PubMed用)
- 访问 NCBI帐户设置
(NCBI 访问帐户设置）
- 使用您的NCBI帐户登录（如果没有，请创建一个）
(NCBI 登录帐户（如果没有）
- 单击“API密钥管理”部分中的“创建API密钥”
(「API Key Management」区域中，单击“创建an API Key”）
- 复制生成的密钥并将其设置在您的
.env文件
（复制生成的键。env 文件设置）
*注：无密钥时，速率限制为3个请求/s，有密钥时为10个请求/s。* *(※ API 没有键时为3req/s、如果有的话req/s 的汇率限制）*
CiNii APP ID (For Japanese Literature / 日本語文献用)
(CiNii API 访问使用注册页面）
- 通过“API注册新应用程序利用登録“（API使用注册）
(「API使用注册“中新注册）
- 填写所需信息和使用目的，然后申请
（输入必要事项，记载使用目的并申请）
- 注册后，您将通过电子邮件收到您的应用程序ID
（注册完成后，通过邮件应用程序ID ），模板名称将采用不同的格式
*注：仅供学术研究之用。* *（※以学术研究为目的的利用为前提）*
配置（.env）
# NCBI Settings (Optional but recommended)
NCBI_API_KEY=your_ncbi_api_key
NCBI_EMAIL=your.email@example.com
NCBI_TOOL_NAME=PubMedMCPServer
# CiNii Settings (Required for Japanese search)
CINII_APP_ID=your_cinii_app_id
# Server Settings
HOST=0.0.0.0
PORT=8000
LOG_LEVEL=INFO许可证
此实现遵循NCBI和CiNii使用策略。 本安装NCBI 以及CiNii 中所述修改相应参数的值。