🏥 MedResearch AI-多智能体系统v6.0.0

用于系统评价和荟萃分析的智能多智能体系统，具有博士级生物统计学、企业级记忆和医学级抗幻觉措施。

](https://github.com/GrimCyberMed/MedResearch-AI/releases) ![License](./LICENSE) ![Build](https://github.com/GrimCyberMed/MedResearch-AI) ![Tools](./docs/) ![Tests](./tests/)

______________________________________________________________________

🎉 v6.0.0-beta的新增功能（第8.5阶段完成！）

第8.5阶段：使用NER提取结果 ⭐ 新

工具： extract-outcome-ner.ts （480行，10/10测试通过）

能力：

7结果实体类型：主要、次要、安全性、疗效结果+测量工具、时间点、效果大小
20+测量标尺：PHQ-9、GAD-7、SF-36、WOMAC、VAS、HbA1c等
时间点提取：基线、随访、具体持续时间
结果测量链接：自动将结果链接到工具和时间点
保守信心评分：30-85%范围，手动审查标记

影响：

第8阶段现已100%完成：所有5个子阶段（8.1-8.5）均已实施
31工具总数：生产就绪的系统审查套件
337测试通过：100%测试成功率
~22500行代码：TypeScript严格模式
100%开放代码：没有外部AI API

第8阶段完整总结：

子阶段	工具	测试	状态
8.1	ML研究设计分类器	15/15	✅
8.2	使用NER提取PICO	15/15	✅
8.3	自动RoB评估	15/15	✅
8.4	研究相关性筛选	10/10	✅
8.5	NER结果提取	10/10	✅
总计	5工具	65/65	✅ 100%

______________________________________________________________________

🎉 v5.1.0（第2阶段）的新增功能

10个新的MCP工具 ⭐ 新

研究代理（3个工具）:

NLP数据提取：从全文中提取PICO、样本大小和结果（速度提高85%）
重复检测：跨数据库的模糊匹配（准确率95%）
研究质量评估：Cochrane RoB 2.0+GRADE自动化（速度提高70%）

编剧代理（3个工具）:

引文格式：10种引用样式（APA、温哥华等）（快90%）
参考列表生成：自动生成、排序的参考列表（速度提高95%）
论文模板：PRISMA、CONSORT、STROBE模板（速度提高60%）

问题代理（3个工具）:

研究问题评分：更精细的标准+PICO完整性（质量提高80%）
PICO提取：自动PICO元素提取（速度提高70%）
文献缺口识别：时间、方法、人口差距（快60%）

Planner Agent（1个工具）:

ML时间线预测：项目时间表预测和风险分析（准确率提高50%）

影响

节省了约69小时 根据系统评价（减少87.3%）
总共46个MCP工具 （31份原件+5份第1期+10份第2期）
生产准备就绪 有全面的文件

______________________________________________________________________

🆕 v5.0.0（第一阶段）的新增功能

5个新的MCP工具 ⭐

引文验证：根据PubMed、CrossRef、RetractionWatch进行批量验证
ML筛查：用于自动优先级排序的TF-IDF相关性评分
语法检查：学术医学写作风格的执行
PRISMA合规性：PRISMA 2020检查表自动验证
项目仪表板：使用Chart.js的实时HTML仪表板

影响

节省了约35小时 根据系统评价
医疗级质量 具有抗幻觉设计

______________________________________________________________________

🆕 v4.2的新增功能

高级统计分析 ⭐ 新

智能测试选择：基于数据特征的自动推荐（50多项测试）
全面假设检查：诊断图的正态性、同质性、线性、异常值
数据质量验证：缺失数据分析、异常检测、重复检查
统计功率分析：样本量规划和事后功率评估
端到端工作流：从验证到可发布报告的完整分析
学习设计意识：为随机对照试验、队列研究、病例对照研究、横断面研究量身定制
报告准则：内置CONSORT、STROBE、PRISMA合规性

v4.1的新增功能

生产硬化

结构化日志记录：基于Winston的旋转JSON日志记录
缓存层：缓存命中率40-60%，5分钟TTL
重试逻辑：瞬态故障的指数回退
输入验证：用于运行时类型安全的Zod模式
性能跟踪：记录所有操作的持续时间

v4.0的新增功能

存储器系统 ⭐

四层架构：短期、工作、长期、偶发
自动检查点：每5分钟+阶段边界
会话恢复：在几天/几周内继续研究
永远不要失去背景：完全保存状态

反幻觉框架 ⭐

引用优先：每个索赔都必须有经过验证的来源
5层防御：接地、验证、确认、信心、人在环
零宽容：捏造引用=立即拒绝
医疗级：0.8置信阈值

会话连续性 ⭐

随时简历：从你停下来的地方继续
一切坚持永远不要忘记接下来会发生什么
相位跟踪：总是知道你的进步
审计跟踪：记录的每个决定

______________________________________________________________________

🎯 系统概述

12名专业代理

主要代理商（9）:

主代理 -编排器+内存管理器
问题代理 -研究问题提炼
规划师代理 -研究规划
协议代理 -PICO/SPIDER协议
研究代理 -数据库搜索和筛选协调
编剧代理 -手稿写作
统计员代理人 -博士级生物统计学+荟萃分析
书目代理 -引文管理
评论家代理人 -质量保证+抗幻觉

次级代理人（3）: 10\. 搜索子代理 -数据库搜索（PubMed，欧洲PMC） 11\. 筛选子代理 -标题/摘要和全文筛选 12\. 萃取子剂 -数据提取和偏差风险评估

46 MCP工具

第二阶段工具（10） ⭐ 新

extract_data_nlp -基于NLP的全文数据提取
检测重复 -跨数据库重复检测
评估_研究_质量 -Cochrane RoB 2.0+等级评估
格式限制 -多样式引文格式
生成引用 -自动生成的参考列表
generate_manuscript_template -日志特定模板
分数搜索问题 -更精细的标准评分
提取pico -自动PICO提取
识别差距 -文献空白识别
预测时间线 -基于机器学习的时间线预测

第一阶段工具（5） ⭐: 11\. 验证_实例_匹配 -批量引文验证 12\. screen_citations_ml -基于机器学习的筛查 13\. 检查语法 -语法和风格检查 14\. check_prisma_合规性 -PRISMA 2020验证 15\. create_project_dashboard -实时仪表板

统计分析（7）: 16\. 选择统计测试 -智能测试选择 17\. 检查_发放 -用图进行假设检验 18\. validate_data -数据质量评估 19\. 计算功率 -功率分析 20\. 运行综合分析 -端到端工作流 21\. run_meta_analysis -使用R的Meta分析 22\. generate_forest_plot -森林地块可视化

数据库搜索（9）: 23\. 搜索已提交 -PubMed/MEDLINE搜索 24\. 搜索_欧洲\_ pmc -欧洲PMC预印本 25\. 搜索_浪漫学者 -200多万篇论文 26\. search_lens -2.5亿+学术著作 27\. 临床试验 -450K+临床试验 28\. 搜索_交叉引用 -150M+DOI元数据 29\. get_semantic_scholar_paper -纸张详细信息 30\. get_lens_work -工作细节 31\. get_clinical_trial -试用详情

引文与文献（6）: 32\. 管理限制 -引文管理 33\. 出口图书 -书目导出 34\. 生成文档 -DOCX生成 35\. export_to_pdf -PDF转换 36\. find_open_access -OA版本查找器 37\. get_crossref_工作 -交叉引用工作细节

剽窃检测（3）: 38\. 检查剽窃 -文件抄袭检查 39\. 比较文档 -直接比较 40\. check_plagiarism_databases -跨数据库检查

总计：所有类别的46个MCP工具

存储器系统

短期的 （本届会议）
工作（当前阶段）
长期（整个项目）
情节性的 （决策历史）

______________________________________________________________________

🚀 快速开始

安装

cd C:\Users\Admin\Documents\AI-Projects\OpenAgents-main\Project\MedResearch-AI

# Install dependencies
npm install

# Build TypeScript
npm run build

开始新的研究

# Start OpenCode with Master Agent
opencode --agent .opencode/agent/medresearch/master-agent.md

# Or use the command
/start-research

恢复现有研究

# Resume from checkpoint
/resume-research

# Or manually
opencode --agent .opencode/agent/medresearch/master-agent.md
> "Resume my diabetes research"

______________________________________________________________________

📁 项目结构

MedResearch-AI/
├── src/                             # Source code
│   ├── common/                      # Shared utilities
│   │   ├── logger.ts               # Winston logging
│   │   ├── cache.ts                # NodeCache caching
│   │   ├── retry.ts                # Retry logic
│   │   └── validation.ts           # Zod schemas
│   └── mcp/                         # MCP server
│       ├── index.ts                # Server entry point
│       └── tools/                  # MCP tools (11 files)
│
├── tests/                           # Test files
│   ├── test-databases.js
│   ├── test-plagiarism.js
│   ├── test-meta-analysis.js
│   └── dashboard.js
│
├── docs/                            # Documentation
│   ├── CHANGELOG.md                # Version history
│   ├── DEVELOPMENT.md              # Developer guide
│   ├── TESTING.md                  # Testing guide
│   ├── GUIDES.md                   # User guides
│   └── archive/                    # Old session files
│
├── assets/                          # Images, plots
├── logs/                            # Runtime logs
├── .memory/                         # Runtime memory
├── package.json
├── tsconfig.json
└── README.md

______________________________________________________________________

🔑 主要特点

核心能力

✅ OpenCode原生 -使用Claude Pro（无API成本）
✅ 免费数据库 -PubMed、欧洲PMC、Lens、OpenAlex
✅ 内存持久性 -SQLite，永远不会失去上下文
✅ 会话连续性 -数天/数周后恢复
✅ 抗幻觉 -引用优先，验证
✅ 符合PRISMA 2020标准 -所有27个检查表项目
✅ 大学可配置 -塞浦路斯欧洲大学（小学）
✅ 质量门 -每个阶段的验证
✅ 审计跟踪 -记录的每一个决定

统计分析 ⭐ 新

✅ 智能测试选择 -自动推荐（50+测试）
✅ 假设检验 -正态性、同质性、线性、异常值
✅ 数据验证 -缺失数据、异常值、重复
✅ 功率分析 -样本量规划，事后功率
✅ 完整的工作流程 -验证→ 表1→ 分析→ 报告
✅ 学习设计意识 -随机对照试验，队列，病例对照，横断面
✅ 报告准则 -配偶、闪光灯、棱镜
✅ 出版物准备就绪 -表1，诊断图，Word报告

______________________________________________________________________

📚 文档

核心文件

总体规划: docs/MASTER-PLAN.md （200+页）
会话提示: docs/SESSION-PROMPT.md
会话摘要: docs/archive/SESSION-SUMMARY-DEC-3-2025.md
更新日志: docs/CHANGELOG.md

统计分析指南 ⭐ 新

统计方法: docs/STATISTICAL-METHODS-GUIDE.md （10000字以上）

- 所有5个统计功能的完整指南 - 20多个具有预期产出的实例 - 决策树和故障排除

假设检验: docs/ASSUMPTION-CHECKING-GUIDE.md （5000+字）

- 解释正态性检验、Q-Q图、诊断图 - 使用决策树处理违规行为

功率分析: docs/POWER-ANALYSIS-GUIDE.md （6000字以上）

- 样本量规划和效应量估计 - 先验、事后和敏感性分析

报告准则: docs/REPORTING-GUIDELINES.md （5000+字）

- CONSORT、STROBE、PRISMA检查表 - 统计报告标准

研究文件: docs/DATA-ANALYSIS-AGENT-RESEARCH.md （10000字以上）

- 全面的生物统计学研究和框架

______________________________________________________________________

🧪 测试

# Run tests
npm test

# Test memory system
npm run test:memory

# Test checkpoint system
npm run test:checkpoint

______________________________________________________________________

📝 许可证

MIT许可证-有关详细信息，请参阅许可证文件

______________________________________________________________________

🎉 状态

版本: 4.0.0\ 状态: ✅ 第三阶段完成（100%）\ 生产状态：MVP已完成，关键修复正在进行中

______________________________________________________________________

📚 文档

快速链接

更改日志.md -版本历史和发行说明
Developpent.md -开发人员指南和代码标准
测试.md -测试指南和测试结果
GUIDES.md -用户指南和教程

入门指南

安装 -请参阅快速开始上方
第一检索 -请参阅 GUIDES.md
运行测试 -请参阅测试.md
发展 -请参阅 Developpent.md

关键文件

对于用户：

数据库搜索策略
剽窃检测指南
Meta分析工作流程
引文管理
文档生成

对于开发者：

规范标准和惯例
添加新的数据库工具
编写测试
调试和故障排除
性能优化

______________________________________________________________________

创建：2025年12月3日\ 最后更新：2025年12月4日\ 作者：MedResearch人工智能团队

Med Research AI

快速接入

详细介绍

🏥 MedResearch AI-多智能体系统v6.0.0

🎉 v6.0.0-beta的新增功能（第8.5阶段完成！）

第8.5阶段：使用NER提取结果 ⭐ 新

第8阶段完整总结：

🎉 v5.1.0（第2阶段）的新增功能

10个新的MCP工具 ⭐ 新

影响

🆕 v5.0.0（第一阶段）的新增功能

5个新的MCP工具 ⭐

影响

🆕 v4.2的新增功能

高级统计分析 ⭐ 新

v4.1的新增功能

生产硬化

v4.0的新增功能

存储器系统 ⭐

反幻觉框架 ⭐

会话连续性 ⭐

🎯 系统概述

12名专业代理

46 MCP工具

存储器系统

🚀 快速开始

安装

开始新的研究

恢复现有研究

📁 项目结构

🔑 主要特点

核心能力

统计分析 ⭐ 新

📚 文档

核心文件

统计分析指南 ⭐ 新

🧪 测试

📝 许可证

🎉 状态

📚 文档

快速链接

入门指南

关键文件

目录标签

接入字段

权限和风险

来源信息

继续浏览同类 MCP