非官方bioRxiv MCP服务器
用于访问bioRxiv和medRxiv预印本服务器的模型上下文协议（MCP）服务器（冷泉港实验室）。提供27个生物学和51个医学科学类别的260000多份预印本。
特性
- 单一统一工具 (
biorxiv_info)7种方法 - 无需API密钥-使用公共bioRxiv API
- 在日期范围浏览中使用客户端过滤进行关键字搜索
- DOI的完整预印本元数据检索（所有版本）
- 出版预印本跟踪（预印本→ 日志映射）
- 按ROR ID搜索资助者（NIH、NSF、Wellcome等）
- 内容和使用统计（提交、查看、下载）
- bioRxiv和medRxiv的受试者类别列表
安装
cd biorxiv-mcp-server
npm install
npm run build用法
{
"mcpServers": {
"biorxiv-mcp-server": {
"command": "node",
"args": ["/path/to/biorxiv-mcp-server/build/index.js"]
}
}
}工具：biorxiv_info
单一统一工具，可通过多种方法访问 method 参数。
方法
1.搜索_打印
按关键字搜索预印本。通过bioRxiv日期范围API（无本机关键字搜索终结点）使用客户端筛选。在整个日期范围内扫描多达300个结果。
{
"method": "search_preprints",
"query": "CRISPR gene editing",
"server": "biorxiv",
"date_from": "2025-01-01",
"date_to": "2025-12-31",
"category": "genetics",
"limit": 30
}返回：doi、标题、作者、摘要（500个字符）、日期、类别、版本、发布状态。
2.获取价格详情
获取DOI特定预印本的完整元数据，包括所有版本。
{
"method": "get_preprint_details",
"doi": "10.1101/2024.01.15.575123",
"server": "biorxiv"
}返回：所有包含doi、标题、作者、完整摘要、日期、类别、许可证、发布状态的版本。
3.类别
列出bioRxiv（27）和medRxiv（51）的所有可用主题类别。
{
"method": "get_categories"
}4.搜索_发布_打印
查找已在同行评审期刊上正式发表的预印本。
{
"method": "search_published_preprints",
"date_from": "2025-01-01",
"publisher": "10.1038",
"server": "biorxiv",
"limit": 30
}常见的出版商DOI前缀： 10.1038 （自然）， 10.1126 （科学）， 10.1016 （爱思唯尔） 10.1371 （PLOS） 10.7554 （eLife）， 10.1073 （PNAs）。
5.搜索\_ \_资助者
使用ROR ID按资助组织查找预印本。数据从2025-04-10开始。
{
"method": "search_by_funder",
"funder_ror_id": "021nxhr62",
"server": "biorxiv",
"limit": 30
}常见ROR ID： 021nxhr62 （NIH）， 01cwqze88 （NSF）， 02mhbdp94 （欧盟委员会）， 029chgv08 （威康信托）， 05a28rw58 （HHMI）， 006wxqw41 （MRC）。
6.内容统计
获取提交统计数据（新论文、修订版、作者）。
{
"method": "get_content_statistics",
"interval": "m"
}时间间隔： "m" （每月）或 "y" （每年）。
7.获取统计信息
获取参与度统计数据（浏览量、下载量）。
{
"method": "get_usage_statistics",
"interval": "m",
"server": "biorxiv"
}Claude查询示例
配置后，您可以询问Claude：
- “在bioRxiv中搜索最近的CRISPR预印本”
- “获取预印本DOI 10.1101/2024.01.55.75123的详细信息”
- “有哪些bioRxiv类别可供选择？”
- “查找本月发表在《自然》杂志上的预印本”
- “展示美国国立卫生研究院资助的癌症生物学预印本”
- “bioRxiv的每月提交统计数据是多少？”
- “搜索medRxiv以获取新冠肺炎疫苗预印本”
重要说明
- 预印本未经过同行评审 --结果不应被引用为既定事实
- 关键词搜索 是客户端（bioRxiv API仅支持日期范围浏览），因此窄的日期范围提高了相关性
- DOI格式:
10.1101/YYYY.MM.DD.NNNNNN（bioRxiv前缀始终为10.1101) - 资助者数据 仅从2025年4月10日起可用
数据源
- 数据库：bioRxiv/medRxiv（冷泉港实验室）
- 预印本：生物和医学领域超过260000人
- 分类：27个生物Rxiv+51个medRxiv受试区域
- API: https://api.biorxiv.org/
- 费率限制：没有公布的限制，鼓励尊重使用
许可证
麻省理工学院